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¿Que has puesto exactamente en la configuración del portlet de alfresco?
Si tienes Alfresco y Liferay en 2 máquinas diferentes, ¿has comprobado si "se ven la una a la otra"?
¿Con que usuario has configurado el portlet? El usuario con el que hayas configurado ha de poder acceder a dichos documentos, es decir, si con ese usuario te conectas a Alfresco, debes de poder ver los documentos.
¿Si haces las mismas consultas desde el buscador que tiene el propio alfresco (arriba a la derecha) encuentra los documentos?